五種致瀉性大腸埃希氏菌鑒定試劑盒(PCR法)說明書
u 產(chǎn)品說明
五種致瀉性大腸埃希氏菌鑒定試劑盒PCR法可針對(duì)食品、飼料等樣品中的致病微生物的特異核酸片段進(jìn)行擴(kuò)增,儀器實(shí)時(shí)監(jiān)測擴(kuò)增過程中的熒光信號(hào)變化,自動(dòng)判讀結(jié)果。本產(chǎn)品用于致瀉大腸埃希氏菌的檢測。檢出限為 103 CFU/ml。
◆ 產(chǎn)品組成(96 測試)
◆ 所需儀器
ABI ,BioRad,TaKaRa 等 PCR 擴(kuò)增儀,電泳儀,凝膠成像儀等電泳配套設(shè)備。(使用熒光定量 PCR 儀進(jìn)行定性判讀時(shí)則無需電泳設(shè)備)
◆ 自備耗材和儀器
①滅菌 1.5mL 或 2.0mL 離心管;②冰盒;③移液器(0.5-10μL,10-100μL,100-1000μL)及配套滅菌吸頭;④ 離心機(jī);⑤渦旋混勻器;⑥金屬浴。
◆ 樣品處理
參照《GB4789.6—2016 食品安全國家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗(yàn)致瀉大腸埃希氏菌檢驗(yàn)》中的操作步驟進(jìn)行前增菌。建議使用試劑配套細(xì)菌基因組 DNA 提取系列產(chǎn)品。
◆ 實(shí)驗(yàn)操作
1.試劑配制(試劑配制區(qū),放置于冰盒中進(jìn)行)取出各管試劑,將試劑*解凍,離心 30s。取 12×(所待檢樣品數(shù)+3)的 PCR 反應(yīng)管,按 12 個(gè)一組排列并編號(hào),依次向各管中加入 23μL 的 12 種反應(yīng)液。
2.添加模板(樣本制備區(qū),放置于冰盒中進(jìn)行)向每管反應(yīng)液中分別加入 2μL 模板(或直接使用無菌吸頭挑取少許待檢菌落至反應(yīng)管中)。加樣示例:(有 N 個(gè)待測樣品)
取(N+3)組 12 個(gè)一組的反應(yīng)管,按順序第一組 12 管中全部加入 2μL 的 NG-DW,第二組 12管中全部加入 2μL的 NG-Ecoli,第三組 12 管中全部加入 2μL 的樣品 1 模板,第四組 12 管中全部加入 2μL 的樣品 2 模板,…,最后組 12 管中全部加入 2μL 的PG-Ecoli。
蓋好 PCR 管蓋后,渦旋混勻 30s,離心 1min,立即進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增反應(yīng)。
3.擴(kuò)增反應(yīng)(擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū))
按下列條件設(shè)置擴(kuò)增反應(yīng):(如需使用熒光法進(jìn)行檢測請選擇 FAM 通道)
PCR 循環(huán) | 熒光收集位點(diǎn) | ||
37℃ | 10 分鐘 | 1 個(gè)循環(huán) | — |
95℃ | 10 分鐘 | 1 個(gè)循環(huán) | — |
95℃ | 30 秒 | 30 個(gè)循環(huán) | — |
63 ℃ | 30 秒 | — | |
72℃ | 90 秒 | ※ | |
72℃ | 5 分鐘 | 1 個(gè)循環(huán) | — |
4.產(chǎn)物電泳(擴(kuò)增及產(chǎn)物分析區(qū))
稱量 4. 0g 瓊脂糖粉,加入至 200 mL 的 1×TAE 電泳緩沖液中,充分混勻。使用微波爐反復(fù)加熱至沸騰,直到瓊脂糖粉*融化形成清亮透明的溶液。待瓊脂糖溶液冷卻至 60℃右時(shí),加入溴化乙錠( EB )至終濃度為 0.5μg/mL, 充分混勻后,輕輕倒入已放置好梳子的模具中,凝膠長度要大于 10cm,厚度宜為 3mm~5mm。檢查梳齒下或梳齒間有無氣泡,用一次性吸頭小心排掉瓊脂糖凝膠中的氣泡。當(dāng)瓊脂糖凝膠*凝結(jié)硬化后,輕輕拔出梳子,小心將膠塊和膠床放入電泳槽中,樣品孔放置在陰。向電泳槽中加入 1×TAE 電泳緩沖液,液面高于膠面 1mm~2mm。將5μL PCR 產(chǎn)物與 1μL 6×上樣緩沖液混勻后,用微量移液器吸取混合液垂直伸入液面下膠孔,小心上樣于孔中;陽性對(duì)照的 PCR 反應(yīng)產(chǎn)物加入到最后一個(gè)泳道;第一個(gè)泳道中加入 2 μ L 分子量 Marker 。接通電泳儀電源,根據(jù)公式: 電壓=電泳槽正負(fù)極間的距離(cm)×5V/cm 計(jì)算并設(shè)定電泳儀電壓數(shù)值;啟動(dòng)電壓開關(guān),電泳開始以正負(fù)極鉑金絲出現(xiàn)氣泡為準(zhǔn)。電泳 30min~45min 后,切斷電源。取出凝膠放入凝膠成像儀中觀察結(jié)果,拍照并記錄數(shù)據(jù)。
u 可使用 Gold view、Gal-Rad 等等效的核酸熒光染料替代 EB。
u 推薦使用 DNA Marker:DL2000 或 100bp ladder,等可指示 100bp~1500bp 條帶的 Marker。
◆ 結(jié)果分析
1.陰陽性判讀:
進(jìn)行電泳檢測時(shí),需對(duì)比 Marker 進(jìn)行判斷,當(dāng)目的靶標(biāo)對(duì)應(yīng)位置出現(xiàn)單一顯著條帶時(shí)可判斷該靶標(biāo)為陽性; 否則為該靶標(biāo)檢測為陰性。(使用熒光定量 PCR 儀檢測時(shí),檢測孔Ct≤30 時(shí)判斷該孔為陽性;當(dāng)檢測孔Ct>30 時(shí), 該檢測孔為陰性)
示例電泳圖
2.有效性判讀:
需同時(shí)滿足:1.空白對(duì)照中所有泳道均為陰性;2.陰性對(duì)照中 uidA 泳道陽性,其余泳道陰性;2.陽性對(duì)照中所有泳道陽性,此時(shí)可判斷實(shí)驗(yàn)有效。如無法滿足上述條件,則實(shí)驗(yàn)無效,需重復(fù)實(shí)驗(yàn);如重復(fù)后結(jié)果仍為無效,請于本公司技術(shù)支持聯(lián)系。
3.結(jié)果判讀:
在實(shí)驗(yàn)有效的情況下,可根據(jù)下表進(jìn)行判讀:
致瀉大腸埃希氏菌類別 | 目標(biāo)條帶的種類組合 | |
EIEC | ipaH(+) | uidA (+/-) |
EAEC | aggR,astA,pic 中一條或一條以上陽性 | |
EPEC | bfpB(+/-),eae(+),stx1(-)stx2,(-) | |
STEC/EHEC | stx1,stx2 中一條或一條以上陽性,eae(+/-),bfpB(-) | |
ETEC | lt,stp,sth 中一條或以上陽性 |
u 97%以上大腸埃希氏菌為 uidA 陽性,可參考陰性對(duì)照中該基因檢測結(jié)果判斷擴(kuò)增效果;
u 當(dāng)結(jié)果判定為EPEC 陽性時(shí),若 bfpB 靶標(biāo)為陽性則說明樣品含有典型EPEC;若 bfpB 靶標(biāo)為陰性則說明樣品為非典型EPEC;
當(dāng)結(jié)果判定為STEC/EHEC 陽性時(shí),若 eae 靶標(biāo)為陽性則說明樣品含有典型EHEC;若 eae 靶標(biāo)為陰性則說明樣品為非典型EHEC。